Институт компьютерных исследований (юр. АНО «ИИКИ») является основателем трех научных журналов, которые получили широкое признание как в России, так и за рубежом. Издания входят во многие международные библиографические и реферативные базы данных (включая WoS и Scopus).

Международный журнал Regular and Chaotic Dynamics публикует оригинальные исследовательские работы, посвященные широкому кругу вопросов в области анализа регулярного и хаотического поведения динамических систем классической механики, физики и смежных наук. Журнал успешно сочетает в себе классические задачи и подходы, современные методы исследования и передовые достижения в области нелинейных динамических систем.

Russian Journal of Nonlinear Dynamics — междисциплинарный журнал по нелинейной динамике, охватывающий как фундаментальные области, так и направления, имеющие прикладное значение. Журнал стремится содействовать развитию многосторонних связей теории и приложений, взаимопроникновению различных дисциплин, применению современных математических и компьютерных методов в изучении реальных динамических систем.

В журнале «Компьютерные исследования и моделирование» публикуются результаты оригинальных исследований и работы обзорного характера в области компьютерных исследований и математического моделирования в физике, технике, биологии, экологии, экономике, психологии и других областях знания.